Скорость определения структуры белков увеличена в 100 раз.

[immortaz]

Ученым из Lawrence Berkeley National Laboratory при помощи метода SAXS (small angle X-ray scattering) удалось за месяц определить структуру 40 белков Pyrococcus furiosus, микроорганизма выживающего в кипящей воде.

Установка SIBYLS находящаяся в подразделении Advanced Light Source (ALS) в Berkeley Lab позволяет  при помощи техники называемой "small angle x-ray scattering" (SAXS) достичь пространственного разрешения в 10 ангстрем, что достаточно для определения структуры практически любой биологической молекулы в растворе. Greg Hura (разработавший эту методику совместно с John Tainer и Michael Adams) установил робота с пипетками который автоматизирует процесс позиционирования образцов молекул для их анализа, а вычислительная мощность установленного там-же суперкомпьютера  позволяет обрабатывать данные с установки, определяя структуры до 20 белков в неделю. Детали экспериментов публикуются на сайте www.bioisis.net

 Команда из Беркли выбрала организм P. furiosus как интригующего кандидата на роль производителя "чистого"топлива. Выживая при 100С в кислотной среде, одна из его химических цепей производит водород, что может быть полезно в энергетике и других приложениях.

Статья под названием “Robust, high-throughput solution structural analyses by small angle X-ray scattering (SAXS)” за авторством Greg Hura, Angeli Menon, Michal Hammel, Robert P. Rambo, Farris Poole, Susan Tsutakawa, Francis Jenney, Scott Classen, Kenneth Frankel, Robert Hopkins, Sung-jae Yang, Joseph Scott, Bret Dillard, Michael Adams, and John Tainer опубликована онлайн, 20 июля в журнале Nature Methods .